Coagularea: este procesul atragerii substanțelor chimice afară din soluție pentru a forma o suspensie coloidală a particulelor mici. Pentru ca coagularea să funcționeze, APF trebuie amestecat imediat și în mod agresiv cu apa. De aceea am proiectat ZPM. Dacă nu se utilizează ZPM se pierde faza de coagulare, iar APF trece direct la floculare.
Flocularea: este procesul de a atrage particulele mici aflate in suspensie coloidală (celule epiteliale, bacterii și paraziți) și a le împreuna pentru a forma particule mari sau floc, ce poate fi îndepărtat ușor de către AFM®.
APF încarcă pozitiv particulele, ce sunt apoi atrase de suprafața încărcată negativ a AFM®. Flocularea durează câteva minute iar particulele sunt foarte fragile, deci apa nu trebuie să fie supusă la agitare agresivă.